Quản trị chi phí, giá thành phức tạp, phân bổ nhiều tiêu thức. Quản trị công đoạn sản xuất, quản lý BOM sản xuất, quản lý tiến độ sản xuất, gia công dược và các quy trình sản xuất dược phẩm từ kế hoạch, đơn hàng, nguyên vật liệu, thành phẩm,…quản lý thủ công sẽ rất khó khăn.